環(huán)境微生物功能基因的定量檢測
在環(huán)境中,微生物起到了重要的作用,而這些作用往往是由微生物的相關(guān)功能基因來決定的。比如,氮循環(huán)相關(guān)功能微生物在土壤發(fā)揮其生態(tài)功能中起著重要的作用,固氮細(xì)菌、反硝化細(xì)菌和硝化細(xì)菌在石油污染土壤生物修復(fù)過程中的演變情況,研究者利用實(shí)時定量PCR技術(shù)對其相關(guān)功能基因nifH、narG和amoA進(jìn)行檢測,再利用標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算獲得基因的絕對拷貝數(shù)。此類研究可以表明結(jié)果表明氮循環(huán)功能基因的動態(tài)監(jiān)測可以從基因和物種水平上反映土壤修復(fù)的效果,為土壤修復(fù)的監(jiān)控和效果評估提供參考。
1、實(shí)時監(jiān)測:通過擴(kuò)增曲線能夠?qū)崟r監(jiān)測PCR產(chǎn)物的積累。
2、特異性強(qiáng):實(shí)驗(yàn)完成后,溶解曲線的分析可以驗(yàn)證擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性,降低假陽性。
3、精確定量:利用擴(kuò)增進(jìn)入指數(shù)增長期的CT值來定量測定起始模板量,從而實(shí)現(xiàn)了極為精確的核酸定量檢測??梢允址奖愕闹滥康幕虻暮俊?/p>
1. 技術(shù)重復(fù)質(zhì)量評估分析;
2. 絕對量計(jì)算
公式(copies/μl)=[質(zhì)粒濃度(ng/ul)×10-9×6.02×1023] / [ 克隆產(chǎn)物堿基數(shù)×660(g/mol)]
載體(pMD 18-T)堿基數(shù) = 2692 bp
3. 對于有生物學(xué)重復(fù)的檢測,計(jì)算SD和p-value。
(一)樣品類型
1. 總DNA;樣品濃度:≥10 ng/ul;樣品總量:>1ug;樣品純度: OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm處有正常峰值。RNA完整性: 電泳檢測28S/18S≥1.5。
2. 組織:樣品取樣后立即液氮速凍,保存于液氮或超低溫冰箱中。請盡量使用新制備的樣品且樣品量至少滿足3次以上提取;
飛凡檢測質(zhì)檢報(bào)告流程:
1、 提供產(chǎn)品資料
2、 工程師根據(jù)您品資料的產(chǎn)品推薦合適檢測項(xiàng)目,并給出報(bào)價
3、 確認(rèn)報(bào)價沒有問題,然后把樣品送到我們實(shí)驗(yàn)室
4、 支付檢測費(fèi)用,安排檢測
5、檢測完成,出具檢測報(bào)告,郵寄給客戶
咨詢熱線:18018131362
關(guān)于飛凡
飛凡檢測致力于打造國內(nèi)專業(yè)的第三方檢測服務(wù)公司,不斷優(yōu)化整合市場檢測資源,飛凡檢測與多家科研院所,如上海同濟(jì)大學(xué),蘇州大學(xué),SGS,TUV,以及國內(nèi)眾多知名的檢測公司進(jìn)行深度合作,共同為國內(nèi)制造業(yè)服務(wù),為中國的制造業(yè)開拓海外市場保駕護(hù)航,為我們?nèi)粘I畹慕】蛋踩珮淞?biāo)桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學(xué)歷;我們合作的實(shí)驗(yàn)室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報(bào)告都有CNAS,CMA資質(zhì),確保出具的每份報(bào)告都具有權(quán)威的法律效力。
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市場需求和成熟的模式給了我們成功的保證
(二)樣本運(yùn)輸
1. 樣本取樣后置于凍存管中并標(biāo)注,使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。